Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHD3Q12873 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms