Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms