Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3550W4VSN7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms