Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms