Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms