Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccne2Q9Z238 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms