Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip6Q9Z1Y4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip6Q9Z1Y4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trip6Q9Z1Y4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms