Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms