Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms