Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sumo3Q9Z172 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms