Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cog1Q9Z160 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms