Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema4fQ9Z123 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema4fQ9Z123 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms