Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn3Q9Z0G9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn3Q9Z0G9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn3Q9Z0G9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn3Q9Z0G9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn3Q9Z0G9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn3Q9Z0G9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn3Q9Z0G9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn3Q9Z0G9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms