Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms