Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ap4s1Q9WVL1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ap4s1Q9WVL1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms