Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Stxbp4Q9WV89 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stxbp4Q9WV89 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms