Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms