Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx1Q9WV80 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx1Q9WV80 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms