Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Vax2Q9WTP9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Vax2Q9WTP9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Vax2Q9WTP9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Vax2Q9WTP9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Vax2Q9WTP9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Vax2Q9WTP9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Vax2Q9WTP9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vax2Q9WTP9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Vax2Q9WTP9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Vax2Q9WTP9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Vax2Q9WTP9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vax2Q9WTP9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Vax2Q9WTP9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Vax2Q9WTP9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Vax2Q9WTP9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vax2Q9WTP9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vax2Q9WTP9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vax2Q9WTP9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vax2Q9WTP9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vax2Q9WTP9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vax2Q9WTP9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vax2Q9WTP9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vax2Q9WTP9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Vax2Q9WTP9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Vax2Q9WTP9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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