Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK8

Spo11, Meiotic recombination protein SPO11, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spo11Q9WTK8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spo11Q9WTK8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spo11Q9WTK8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spo11Q9WTK8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spo11Q9WTK8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spo11Q9WTK8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spo11Q9WTK8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spo11Q9WTK8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spo11Q9WTK8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms