Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Psmb3Q9R1P1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms