Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0K7

Atp2b2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b2Q9R0K7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b2Q9R0K7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b2Q9R0K7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b2Q9R0K7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b2Q9R0K7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b2Q9R0K7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b2Q9R0K7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b2Q9R0K7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b2Q9R0K7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b2Q9R0K7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b2Q9R0K7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b2Q9R0K7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2b2Q9R0K7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp2b2Q9R0K7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp2b2Q9R0K7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms