Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d3cQ9QZS8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms