Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
VapbQ9QY76 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms