Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan3Q9QY33 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan3Q9QY33 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms