Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ6

Slco1a1, Solute carrier organic anion transporter family member 1A1, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1a1Q9QXZ6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slco1a1Q9QXZ6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slco1a1Q9QXZ6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1a1Q9QXZ6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1a1Q9QXZ6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1a1Q9QXZ6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1a1Q9QXZ6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Slco1a1Q9QXZ6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1a1Q9QXZ6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1a1Q9QXZ6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Slco1a1Q9QXZ6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slco1a1Q9QXZ6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Slco1a1Q9QXZ6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slco1a1Q9QXZ6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slco1a1Q9QXZ6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Slco1a1Q9QXZ6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Slco1a1Q9QXZ6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Slco1a1Q9QXZ6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slco1a1Q9QXZ6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Slco1a1Q9QXZ6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Slco1a1Q9QXZ6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Slco1a1Q9QXZ6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slco1a1Q9QXZ6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slco1a1Q9QXZ6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slco1a1Q9QXZ6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slco1a1Q9QXZ6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slco1a1Q9QXZ6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slco1a1Q9QXZ6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Slco1a1Q9QXZ6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Slco1a1Q9QXZ6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms