Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms