Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms