Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms