Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms