Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd2apQ9JLQ0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms