Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Uchl3Q9JKB1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
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