Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Bco1Q9JJS6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Bco1Q9JJS6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Bco1Q9JJS6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Bco1Q9JJS6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Bco1Q9JJS6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Bco1Q9JJS6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Bco1Q9JJS6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bco1Q9JJS6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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