Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms