Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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