Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR1

Ndel1, Nuclear distribution protein nudE-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndel1Q9ERR1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndel1Q9ERR1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms