Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

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Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Slc28a3Q9ERH8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Slc28a3Q9ERH8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Slc28a3Q9ERH8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Slc28a3Q9ERH8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Slc28a3Q9ERH8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Slc28a3Q9ERH8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Slc28a3Q9ERH8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc28a3Q9ERH8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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