Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dap3Q9ER88 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms