Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp3a44Q9EQW4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms