Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms