Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms