Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
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Hmg20aQ9DC33 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hmg20aQ9DC33 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Hmg20aQ9DC33 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Hmg20aQ9DC33 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Hmg20aQ9DC33 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Hmg20aQ9DC33 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmg20aQ9DC33 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmg20aQ9DC33 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmg20aQ9DC33 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Hmg20aQ9DC33 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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