Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Syde1Q9DBZ9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms