Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tm9sf1Q9DBU0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tm9sf1Q9DBU0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tm9sf1Q9DBU0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tm9sf1Q9DBU0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tm9sf1Q9DBU0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tm9sf1Q9DBU0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tm9sf1Q9DBU0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tm9sf1Q9DBU0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tm9sf1Q9DBU0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tm9sf1Q9DBU0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tm9sf1Q9DBU0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tm9sf1Q9DBU0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tm9sf1Q9DBU0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tm9sf1Q9DBU0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms