Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Smg9Q9DB90 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Smg9Q9DB90 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Smg9Q9DB90 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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Smg9Q9DB90 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Smg9Q9DB90 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Smg9Q9DB90 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Smg9Q9DB90 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smg9Q9DB90 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smg9Q9DB90 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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