Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fundc1Q9DB70 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms