Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc89Q9DA73 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc89Q9DA73 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms