Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tmem239Q9DA47 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tmem239Q9DA47 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tmem239Q9DA47 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tmem239Q9DA47 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tmem239Q9DA47 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tmem239Q9DA47 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem239Q9DA47 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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