Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx5Q9D8U8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms