Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms